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gsea分析和go的区别?

因此GSEA可以看作是GO和KEGG的补充和进阶,它检测的是基因集而不是单个基因的表达变化,得到更为理想的结果。


GSEA与传统GO、KEGG分析的区别:

(1)输入文件:GSEA是表达矩阵,传统的富集分析是基因名列表;

(2)排序:GSEA分析前需要根据表达量对基因进行排序,传统的GO、KEGG富集分析不需要;

(3)差异分析:GSEA不需要进行差异分析;

(4)目的:传统的富集分析主要关注的差异显著基因的功能,GSEA关注的是某个生物状态下功能基因集的变化。

匿名回答于2024-05-29 17:26:13


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